7月29日,美国圣路易斯大学终身副教授张大鹏做客皇家娱乐城 水产所学术论坛,以“Deciphering Biological Conflicts with Deep Genome Mining”为题,向大家展示了团队在利用生物信息学与机器学习研究生物冲突分子机制的研究进展。论坛由皇家娱乐城 水产所育种学科学术带头人胡红霞研究员主持,水产所副所长宋海亮及有关科研人员、北京师范大学庞尔丽教授、北京信息科技大学张世玉教授及其学生等30余人参加了此次活动。

张老师从生物冲突在微生物生态与人类健康中的核心地位切入,阐述了多态毒素—免疫子系统在细菌抵御病原体及宿主—病原相互作用中的关键角色与分子机制,并以柑橘黄龙病和霍乱等致病菌为例,展示了如何通过深度基因组挖掘发现新的效应蛋白家族及其进化多样性,为揭示病原菌利用特殊毒素系统侵染并破坏宿主的机制提供了重要的分子基础。此外,他还分享了其团队自主开发的机器学习方法在蛋白结构域分类、功能预测及抗生素耐药性等领域的最新应用。整场报告条理清晰、深入浅出,不仅展示了一个从基因组学到机器学习的跨学科研究框架,也为与会者在科学研究中如何发现问题、解决问题并推动实际应用提供了宝贵的思路。报告结束后,现场师生围绕机器学习模型在功能预测中面临的数据挑战等议题,与张老师展开了热烈而深入的讨论。
张大鹏副教授长期聚焦于利用生物信息学、基因组学、进化理论和机器学习技术研究生物冲突的分子机制、生物分子的多样化机制、蛋白质结构域分类与功能预测,新型生物信息学与机器学习方法开发及专用数据库构建等生物学及健康问题。担任International Journal of Molecular Sciences、Scientific Reports、Microbiology Spectrum等国际学术期刊编委;为Nature Microbiology和Nature Communications等19个国际学术期刊审稿人。在PNAS,Nucleic Acids Research等期刊发表论文77篇,总引用超过4800次。

作 者: 闫潇雨、王巍
通讯员: 董颖
审核员: 宋海亮