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1995年由科技部批复建立，开展蔬菜种质资源评价、基因挖掘、突破性蔬菜新品种培育等研究，满足新时期蔬菜产业发展的需求。建成开放、共享的蔬菜种质资源信息系统；建立辐射全国不同气候带的育种与示范工作站，使实验室基础设施和育种水平保持在全国领先水平；建立适应现代农业发展的蔬菜分子育种体系，推进蔬菜种质创新能力提升；建立模式化、工程化、细化分工的种业科技创新模式，在高端蔬菜的育种上集中突破，在全产业链上进行集成创新，有效推进蔬菜产业发展。