2022年由科技部批准建设，本实验室将以实现我国蔬菜种源自主可控为使命，瞄准世界蔬菜种业科技前沿，针对蔬菜优异种质资源挖掘与利用不足、优异基因缺乏、重要农艺性状机理解析不清、育种技术亟待提高、优质多抗和高产稳产重大新品种缺乏等制约我国蔬菜种业发展的科学问题，以白菜、甘蓝、马铃薯、番茄、黄瓜、西瓜、甜瓜等主要蔬菜为研究对象，利用人工智能等新理论和新方法开展种质资源精准鉴定；利用多组学大数据开展主要蔬菜多样性形成和优异种质演化规律研究，解析蔬菜品质、抗逆、产量等重要农艺性状的遗传机理和调控机制；利用全基因组选择、基因编辑、转基因等关键技术，实现多基因聚合与协同改良的蔬菜品种智能设计，创制一批突破性新种质，培育一批重大新品种，基本实现核心种源自主可控，保障国家“菜篮子”产品高效安全供给。