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2015年由北京市科委批注建设，聚焦万物智联时代人-机-植物的互联互通互操作，致力于实现对农林植物生命系统、生产系统和生态系统的高效感知、认知和管控。面向北京市农业新定位、世界范围内作物科学向数据科学的转型以及我国大力发展“智慧农业”的现实需求，加强数字植物的基础研究和应用基础研究，构建完善的数字植物理论技术体系和研究开发应用平台。农林植物表型组学和多组学大数据挖掘研究是数字植物的重要基础内容，开展3D时空表型组学理论技术研究，突破农林植物表型组大数据获取解析、基于表型组大数据的优异性状知识图谱构建、结构功能互反馈机制模型构建、作物种质资源资源表型精准鉴定算法构建、基于多组学大数据的表型预测等核心关键技术，建立面向种质资源鉴定、优良性状基因挖掘、品种认知算法和良种良法智慧生产的云平台是当前工作重点工作。实验室将在研究力量上合理布局，在实验室建设上完善功能、创新体制，统筹人才发展，逐渐建立科研设施条件一流、功能完备、人才队伍精干、运转高效的数字植物研究实验室。