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2014年由北京市科委批注建设，结合国家中长期科技发展战略和十四五种业科技发展规划，瞄准国内外杂交小麦分子遗传育种研究的前言课题，探索、解析二系杂交小麦光温敏雄性不育分子机理以及杂种优势机理，取得一批标志性原创成果，为二系杂交小麦可持续发展和进一步突破奠定重要理论基础；开展高效转基因技术与分子标记辅助选择的多基因聚合共性关键技术研发，为快速培育高产、优质、多抗的杂交小麦新品种提供技术支持；建立快速、准确、高通量的小麦品种DNA指纹检测技术平台，为杂交小麦亲本提供遗传多样性及群体结构分析，指导杂交小麦育种，同时为我国区试品种管理、品种审定、市场监管、新品种保护以及司法鉴定提供技术支撑体系。