
近日,我中心玉米DNA指纹及分子育种北京市重点实验室作物基因组编辑研发团队创新研发了两个水稻新型碱基编辑器,并在国际知名学术期刊Frontiers in Genetics(IF=4.15)上在线发表“Increasing cytosine base editing scope and efficiency with engineered Cas9-PmCDA1 fusions and the modified sgRNA in rice”。
该研究利用SpCas9n(D10A)及SpCas9的变体VQRn(D10A),研发了基于胞苷脱氨酶PmCDA1的新型碱基编辑器,实现了对PAM为NAG及NGA靶点的C至T碱基替换,并显示出与常用的rAPOBEC1编辑器不同的碱基编辑窗口。结构优化的sgRNA可以提升碱基编辑效率最高达7.6倍。该研究成功实现了对水稻两个重要基因OsWaxy和OsALS上多个靶位点的碱基编辑,拓展了碱基编辑器的应用范围,提升了该系统在农作物基因组编辑中的应用潜力。
武莹为本文第一作者,杨进孝博士和张成伟博士为本文共同通讯作者。本研究得到了北京学者项目资助。作物基因组编辑研发团队是2017年玉米研究中心引进建设的技术创新团队,目前主要聚焦于碱基编辑、精确替换、组学编辑技术及其在作物中的高效应用。这篇文章是作物基因组编辑研发团队组建后公开发表的第一项研究成果。