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水产所在鲟鱼基因组选择研究中取得新进展

近日,皇家娱乐城 水产科学研究所在鲟鱼基因组选择方面取得新突破,相关研究成果以“Prioritized SNP Selection from Whole-Genome Sequencing Improves Genomic Prediction Accuracy in Sturgeons Using Linear and Machine Learning Models”为题,发表在分子生物学领域TOP期刊 International Journal of Molecular Sciences 上(Q1,IF: 4.9)。



本研究以俄罗斯鲟为对象,围绕怀卵量、卵颜色和体重三项核心育种性状,基于971尾个体的全基因组重测序数据,系统评估了三种SNP筛选策略(GWAS优选、连锁不平衡筛选和随机抽样)在不同标记密度下的预测效果。结果显示,GWAS优选SNP在中高密度下显著提高了基因组预测准确性,最高可提升3.4%。同时,机器学习模型(特别是随机森林)整体优于传统线性模型,进一步提升了预测准确性。本研究建立了一套结合GWAS分析和机器学习的鲟鱼基因组选择方法,为鲟鱼产业高效育种提供了技术支撑。

宋海亮副研究员为该项成果第一作者,胡红霞研究员为通讯作者,研究工作得到国家自然科学基金青年项目(32341059、32202915)、院优科项目(YKPY2025004)以及北京市乡村振兴项目(NY2401200024)的资助。